对家庭祖先的供奉，从长者去世后就开始“百日祭”、“周年祭”，此后，除了定期举行的祭祖活动外，遇有特殊情况，及时祭祖。对父母亲亡灵有“生祭”和“冥祭”，民俗以“冥祭”为主，俗称“做忌”。再则是对祖父母亡灵的供祭，祖父母以上的先人较少单独祭祀，但在祭父母或祖父母时，有时也把所有的先祖一并供祭。
祭祖的地点，有在坟墓、祠堂或家中，以家中为主。家祭要在正厅供桌上设祖先灵位的神龛，俗称“祖龛”，龛内有祖先牌位，俗称“神主”。后逐渐用遗像代替神主。厦门寺庙还可让人寄存“神主”，并可代为祭祀。
祭祖的供品，平时的初一、十五较简单，而在逢年过节较丰富，有“三牲”，供桌上摆酒杯(杯中要斟上酒)、筷子、荤素菜肴，近亲也要携祭品来供奉，按辈分大小先后点香膜拜，为亡灵上香只能两支，如亡灵辈分高或德高望重的也可上香3支。按民俗做忌仪式一定要在中午12点以前结束，结束前要由主祭人卜筊，一正一反，表示被祭者已吃饱，祭者再跪拜后开始烧冥钱。若筊两只面皆朝上，俗称“笑筊”，表示尚未吃饱；若筊两只面都朝下，俗称“阴螿”，表示亡灵对祭品或具体的参祭者不满。对出现“笑筊”要等片刻，让亡灵吃饱再卜；而对出现“阴螿”再卜时，恳求亡灵息怒，原谅子孙无知冒犯，然后再卜，如卜3次都不行，说明亡灵对卜者不满，要换他人卜之，也是3次，再不行，再换人，直至一人卜成。烧金银纸时，其金银面要朝上，烧时不能人为捅破，以免破损冥钱，有的冥钱烧完时，要用祭桌上的杯酒，在烧钱炉周围浇洒一圈。祭毕的菜肴也成了家宴，而民俗认为一定要吃祭品，因吃过祖宗吃过的东西，才能得到祖宗的保佑。来参祭的近亲也要带些供品回去，让在家的亲人吃后同样能受到祖宗的荫护。
“三月三”是厦门的敬祖节。传说郑成功据厦抗清时，认为“清明节”名称中的清在前，明在后，含有清除明朝之意，所以要人们不在清明节扫墓，而改在“三月三”敬祖。人们久而习之，把三月初三作为祭祖的日子。到清统一全国后，民间除了三日节祭祖外，也在清明节到先人坟前扫墓化纸，洒酒献食，拜祭先人。后厦门人常把这两个节合称“清明三日节”，中心活动就是扫墓祭祖。
宗族祭祖仪式更为隆重，主祭官跪于案前向列祖列宗三上香，敬酒，供献丰盛的筵食。没有祠堂祖厝的居民则在家中供祭，摆酒席、点香烛、烧纸钱、放鞭炮。按常规祭祖仪式进行。
厦门还有“敬祖”习俗，有的是祭祀海神，有的是祭祀无主游魂，甚至有民族的祖先。敬祀时，祭者没有具体的祭祀对象。逢年过节常有这种“敬祖”习俗。
“祭海神”一般在渔民中盛行，不同于祭妈祖，而是认为渔民的一些祖先在海难后成为海神，因而每年定期隆重地祭海神，后逐渐成为渔民许愿庆丰收的节日。
对“无主游魂”，无后人祭拜的，集中在七月“普渡”，“七月朔起，各里社醮作盂兰盆会，俗称普渡，祀无主之魂。以竹竿燃灯极高，联缀如星，又设高台陈供品”。从七月初一“开地狱门”起，一直到七月三十日“关地狱门”时止。七月初一至三十，每个地区每条街道都轮到一天做“普渡”。常供“三牲”，菜肴、糕?$、米饭，点香燃烛，烧冥钱，放鞭炮。祭完后开始宴请亲朋，俗称“请普渡”，“中元，各祭其先，焚五色楮。楮画绮绣，云为泉下送寒衣”。
“中元节”在七月十五日，不但要敬祖而且要祭孤魂。
